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Todos os materiais biológicos (sangue, secreções, dentre outros) após utilização, são embalados em sacos de autoclavação.
Estes materiais são submetidos à autoclavação a 121º C durante 30 minutos. Todo este processo é monitorado com controles de qualidade que envolvem calibração do manômetro de pressão, seguida pela utilização de fitas termocrômicas em cada ciclo de autoclavação e controle biológico utilizando Baccillus Stheathemophilus semanalmente.
 
Em seguida após o resfriamento este saco de autoclavação contendo os tubos autoclavados, são acondicionados em caixas coletoras resistentes.
 
Depois de fechada corretamente esta caixa é colocada dentro de um saco leitoso apropriado para descarte de material biológico e encaminhado para pesagem. Em seguida é colocado no container de material biológico no abrigo destinado a estes materiais, até ser coletado e encaminhado para a vala séptica.
 
Quanto ao tratamento dispensado aos efluentes, o Cedilab possui um sistema que inclui: fossa séptica, filtro anaeróbico e uma casa de química. Trimestralmente são dosadas diversas substâncias nas caixas pré e pós-tratamento, avaliando com isto a eficiência deste sistema.
 
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